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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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Data corrente: |
25/01/2024 |
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Data da última atualização: |
25/01/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ENEAS, J. S. M.; EVANGELISTA, B. A.; LIMEIRA, A. S.; PAZ, L. R. de S.; DIAS, T. S. dos S.; PEIXOTO, T. L.; SIMON, J.; CAMARGO, F. P. de; ALVES, M. V. G. |
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Afiliação: |
JÚLIA STEPHANE MELO ENEAS, mestrand UFT; BALBINO ANTONIO EVANGELISTA, CNPASA; ARTEMISIA SOARES LIMEIRA, graduanda Porto Nacional-TO; LAURA RESPLANDES DE SOUSA PAZ, Bolsista CNPASA; TAÍS SOUZA DOS SANTOS DIAS, mestranda ESALQ; THARLYSON LIMA PEIXOTO, Centro Universitário Católica do Tocantins; JONES SIMON, CNPASA; FRANCELINO PETENO DE CAMARGO, CNPASA; MARCOS VINICIUS GIONGO ALVES, UFT. |
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Título: |
Desempenho da cultivar de soja DM80I79 IPRO em diferentes ambientes do Cerrado Tocantinense. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 22., 2023, Natal. A agrometeorologia e a agropecuária: adaptação às mudanças climáticas: anais... Natal: Sociedade Brasileira de Agrometeorologia, 2023. |
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Páginas: |
p. 2244-2254. |
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ISBN: |
978-65-85111-14-0 |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
CBAGRO 2023. |
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Conteúdo: |
Diante das particularidades edafoclimáticas do Cerrado Tocantinense, a compreensão do comportamento dos fatores abióticos dentro da exploração da cultura da soja é fundamental para superar as limitações existentes e, consequentemente, aumentar a sua produtividade no Estado. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivo analisar o crescimento, desenvolvimento e rendimento da cultivar de soja DM80i79 IPRO no Cerrado Tocantinense, levando em consideração diferentes ambientes. Os experimentos foram conduzidos no ano safra de 2022/23 nos municípios de Palmas - TO e Porto Nacional - TO. A implantação dos experimentos ocorreu no final de novembro de 2022 com a semeadura da cultivar DM80i79 IPRO nas duas localidades. Foram realizadas avaliações do comportamento das variáveis climáticas durante o cultivo da soja e do desempenho agronômico e produtivo da cultura. As médias das variáveis analisadas foram submetidas ao teste de Scott-Knott (p<0,01) e apresentadas na forma de gráficos. Os dados climáticos coletados e estimados através do modelo SARRA também foram apresentados na forma de gráficos. O crescimento, desenvolvimento e rendimento da cultivar DM80i79 IPRO não apresentaram diferenças significativas quando comparadas as diferentes localidades onde foi cultivada, refletindo, portanto, um desempenho padrão para a cultivar nos ambientes do Cerrado Tocantinense. A cultivar DM80i79 IPRO apresentou uma alta eficiência produtiva para a região em condições climáticas favoráveis ao seu cultivo. MenosDiante das particularidades edafoclimáticas do Cerrado Tocantinense, a compreensão do comportamento dos fatores abióticos dentro da exploração da cultura da soja é fundamental para superar as limitações existentes e, consequentemente, aumentar a sua produtividade no Estado. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivo analisar o crescimento, desenvolvimento e rendimento da cultivar de soja DM80i79 IPRO no Cerrado Tocantinense, levando em consideração diferentes ambientes. Os experimentos foram conduzidos no ano safra de 2022/23 nos municípios de Palmas - TO e Porto Nacional - TO. A implantação dos experimentos ocorreu no final de novembro de 2022 com a semeadura da cultivar DM80i79 IPRO nas duas localidades. Foram realizadas avaliações do comportamento das variáveis climáticas durante o cultivo da soja e do desempenho agronômico e produtivo da cultura. As médias das variáveis analisadas foram submetidas ao teste de Scott-Knott (p<0,01) e apresentadas na forma de gráficos. Os dados climáticos coletados e estimados através do modelo SARRA também foram apresentados na forma de gráficos. O crescimento, desenvolvimento e rendimento da cultivar DM80i79 IPRO não apresentaram diferenças significativas quando comparadas as diferentes localidades onde foi cultivada, refletindo, portanto, um desempenho padrão para a cultivar nos ambientes do Cerrado Tocantinense. A cultivar DM80i79 IPRO apresentou uma alta eficiência produtiva para a região em condições climáticas favoráveis ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Tocantins. |
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Thesagro: |
Características Agronômicas; Cerrado; Glycine Max; Produtividade; Soja. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1161334/1/cbagro-2023-p2244.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA) |
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Biblioteca |
ID |
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Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
16/11/2017 |
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Data da última atualização: |
09/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
OLIVEIRA JÚNIOR, G. A.; CHUD, T. C. S.; VENTURA, R. V.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; MUNARI, D. P.; FERRAZ, J. B. S.; MULLART, E.; DeNISE, S.; SMITH, S.; SILVA, M. V. G. B. |
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Afiliação: |
Gerson A. Oliveira Júnior, USP; Tatiane C. S. Chud, UNESP; Ricardo V. Ventura, University of Guelph, Guelph, Canada; Dorian J. Garrick, Iowa State University, Ames; John B. Cole, United States Department of Agriculture, Agricultural Research Service, Maryland, USA; Danísio Prado Munari, UNESP Jaboticabal; José B. S. Ferraz, USP; Erik Mullart, CRV Holding B. V., Arnhem, 454, the Netherlands; SUE DeNISE, Zoetis, Kalamazoo, MI; SHANNON SMITH, Zoetis, Kalamazoo, MI; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL. |
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Título: |
Genotype imputation in a tropical crossbred dairy cattle population. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Dairy Science, v. 100, n. 12, p. 9623-9634, 2017. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3168/jds.2017-12732 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The objective of this study was to investigate different strategies for genotype imputation in a population of crossbred Girolando (Gyr × Holstein) dairy cattle. The data set consisted of 478 Girolando, 583 Gyr, and 1,198 Holstein sires genotyped at high density with the Illumina BovineHD (Illumina, San Diego, CA) panel, which includes ∼777K markers. The accuracy of imputation from low (20K) and medium densities (50K and 70K) to the HD panel density and from low to 50K density were investigated. Seven scenarios using different reference populations (RPop) considering Girolando, Gyr, and Holstein breeds separately or combinations of animals of these breeds were tested for imputing genotypes of 166 randomly chosen Girolando animals. The population genotype imputation were performed using FImpute. Imputation accuracy was measured as the correlation between observed and imputed genotypes (CORR) and also as the proportion of genotypes that were imputed correctly (CR). This is the first paper on imputation accuracy in a Girolando population. The sample-specific imputation accuracies ranged from 0.38 to 0.97 (CORR) and from 0.49 to 0.96 (CR) imputing from low and medium densities to HD, and 0.41 to 0.95 (CORR) and from 0.50 to 0.94 (CR) for imputation from 20K to 50K. The CORRanim exceeded 0.96 (for 50K and 70K panels) when only Girolando animals were included in RPop (S1). We found smaller CORRanim when Gyr (S2) was used instead of Holstein (S3) as RPop. The same behavior was observed between S4 (Gyr + Girolando) and S5 (Holstein + Girolando) because the target animals were more related to the Holstein population than to the Gyr population. The highest imputation accuracies were observed for scenarios including Girolando animals in the reference population, whereas using only Gyr animals resulted in low imputation accuracies, suggesting that the haplotypes segregating in the Girolando population had a greater effect on accuracy than the purebred haplotypes. All chromosomes had similar imputation accuracies (CORRsnp) within each scenario. Crossbred animals (Girolando) must be included in the reference population to provide the best imputation accuracies. MenosThe objective of this study was to investigate different strategies for genotype imputation in a population of crossbred Girolando (Gyr × Holstein) dairy cattle. The data set consisted of 478 Girolando, 583 Gyr, and 1,198 Holstein sires genotyped at high density with the Illumina BovineHD (Illumina, San Diego, CA) panel, which includes ∼777K markers. The accuracy of imputation from low (20K) and medium densities (50K and 70K) to the HD panel density and from low to 50K density were investigated. Seven scenarios using different reference populations (RPop) considering Girolando, Gyr, and Holstein breeds separately or combinations of animals of these breeds were tested for imputing genotypes of 166 randomly chosen Girolando animals. The population genotype imputation were performed using FImpute. Imputation accuracy was measured as the correlation between observed and imputed genotypes (CORR) and also as the proportion of genotypes that were imputed correctly (CR). This is the first paper on imputation accuracy in a Girolando population. The sample-specific imputation accuracies ranged from 0.38 to 0.97 (CORR) and from 0.49 to 0.96 (CR) imputing from low and medium densities to HD, and 0.41 to 0.95 (CORR) and from 0.50 to 0.94 (CR) for imputation from 20K to 50K. The CORRanim exceeded 0.96 (for 50K and 70K panels) when only Girolando animals were included in RPop (S1). We found smaller CORRanim when Gyr (S2) was used instead of Holstein (S3) as RPop. The same behavior was obse... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Impute. |
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Thesaurus NAL: |
genotype; single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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520 $aThe objective of this study was to investigate different strategies for genotype imputation in a population of crossbred Girolando (Gyr × Holstein) dairy cattle. The data set consisted of 478 Girolando, 583 Gyr, and 1,198 Holstein sires genotyped at high density with the Illumina BovineHD (Illumina, San Diego, CA) panel, which includes ∼777K markers. The accuracy of imputation from low (20K) and medium densities (50K and 70K) to the HD panel density and from low to 50K density were investigated. Seven scenarios using different reference populations (RPop) considering Girolando, Gyr, and Holstein breeds separately or combinations of animals of these breeds were tested for imputing genotypes of 166 randomly chosen Girolando animals. The population genotype imputation were performed using FImpute. Imputation accuracy was measured as the correlation between observed and imputed genotypes (CORR) and also as the proportion of genotypes that were imputed correctly (CR). This is the first paper on imputation accuracy in a Girolando population. The sample-specific imputation accuracies ranged from 0.38 to 0.97 (CORR) and from 0.49 to 0.96 (CR) imputing from low and medium densities to HD, and 0.41 to 0.95 (CORR) and from 0.50 to 0.94 (CR) for imputation from 20K to 50K. The CORRanim exceeded 0.96 (for 50K and 70K panels) when only Girolando animals were included in RPop (S1). We found smaller CORRanim when Gyr (S2) was used instead of Holstein (S3) as RPop. The same behavior was observed between S4 (Gyr + Girolando) and S5 (Holstein + Girolando) because the target animals were more related to the Holstein population than to the Gyr population. The highest imputation accuracies were observed for scenarios including Girolando animals in the reference population, whereas using only Gyr animals resulted in low imputation accuracies, suggesting that the haplotypes segregating in the Girolando population had a greater effect on accuracy than the purebred haplotypes. All chromosomes had similar imputation accuracies (CORRsnp) within each scenario. Crossbred animals (Girolando) must be included in the reference population to provide the best imputation accuracies.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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